Perde arkasında kalmayı tercih eden darbeciler, yönetimiBaas Partisi'ne verdi. Devlet Başkanlığına Abdüsselam Arif getirildi; ancak yasama veyürütme yetkileri Ulusal Devrim Komuta Konseyine verildi. Başbakanlığa Albay AhmetHasan el-Bekr atandı. Bir süre sonra Baas Partisi arasında görüş ayrılıkları başgösterdi ve bölünmeler oldu. Abdüsselam Arif'in yetkileri geniş ölçüde kısıtlandı.Bu durumdan yararlanan Arif, ordunun desteğiyle Kasım 1963'te Baasçıları tasfiyeetti. Devletleştirme politikası güden Arif, ekonominin daha da kötüleşmesi üzerine,sivil yönetime geçme hazırlığı yaptı ve ordunun yönetimdeki ağırlığına sonvermeğe başladı.

Nisan 1966'da meydana gelen bir helikopter kazasındaAbdüsselam Arif'in ölmesi üzerine, büyük kardeşi Abdurrahman Arif devlet başkanlığınagetirildi. Birkaç ay sonra subayların baskısı ile sivil yönetim istifa etti ve yönetimetekrar ordu hakim oldu. Hizip çekişmeleri yüzünden yönetim sürekli el değiştirdi.Sonunda hizipler, Baas Partisi ile iş birliği yaparak, iktidara gelme planları yaptı.Baas Partisi de bu hiziplerin desteğinden yararlanarak, 17 Temmuz 1968'de el-Bekr'in öncülüğündeyaptığı darbe ile yönetime geldi. Devlet başkanlığına ve başbakanlığınagetirilen el-Bekr, oluşturulanDevrim Komuta Konseyi'nin başkanı sıfatı ile en üst yönetimlideri olarak, ülkenin kaderine hakim oldu.